Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF1Q05048 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms