RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412368.6

JMJD8-201, Transcript of jumonji domain containing 8, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD8, Length 2,038 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8-201ENST00000412368 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.89■■■■■ 6.7
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JMJD8-201ENST00000412368 NACADO15069 1562 aa47.18■■■■■ 5.14
JMJD8-201ENST00000412368 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.15■■■■■ 5.14
JMJD8-201ENST00000412368 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47■■■■■ 5.11
JMJD8-201ENST00000412368 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.98■■■■■ 5.11
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JMJD8-201ENST00000412368 SCRIBQ14160 1630 aa46.11■■■■■ 4.97
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JMJD8-201ENST00000412368 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.24■■■■■ 4.67
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JMJD8-201ENST00000412368 SMARCA2P51531 1590 aa43.62■■■■■ 4.57
JMJD8-201ENST00000412368 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.56■■■■■ 4.56
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JMJD8-201ENST00000412368 NCAPD3P42695 1498 aa43.52■■■■■ 4.56
JMJD8-201ENST00000412368 WIZO95785 1651 aa43.51■■■■■ 4.56
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JMJD8-201ENST00000412368 NESP48681 1621 aa42.49■■■■■ 4.39
JMJD8-201ENST00000412368 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.33■■■■■ 4.37
JMJD8-201ENST00000412368 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.31■■■■■ 4.36
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JMJD8-201ENST00000412368 ERCC6Q03468 1493 aa42.08■■■■■ 4.33
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JMJD8-201ENST00000412368 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.01■■■■■ 4.32
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JMJD8-201ENST00000412368 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.77■■■■■ 4.28
JMJD8-201ENST00000412368 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
JMJD8-201ENST00000412368 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.59■■■■■ 4.25
JMJD8-201ENST00000412368 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
JMJD8-201ENST00000412368 WDR62O43379 1518 aa41.44■■■■■ 4.23
JMJD8-201ENST00000412368 CUX2O14529 1486 aa41.36■■■■■ 4.21
JMJD8-201ENST00000412368 TOPBP1Q92547 1522 aa41.27■■■■■ 4.2
JMJD8-201ENST00000412368 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.24■■■■■ 4.19
JMJD8-201ENST00000412368 ABCC8Q09428 1581 aa41.19■■■■■ 4.19
JMJD8-201ENST00000412368 CUX1P39880 1505 aa41.17■■■■■ 4.18
JMJD8-201ENST00000412368 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.16
JMJD8-201ENST00000412368 SYNJ1O43426 1573 aa40.99■■■■■ 4.15
JMJD8-201ENST00000412368 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
JMJD8-201ENST00000412368 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.94■■■■■ 4.15
JMJD8-201ENST00000412368 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.91■■■■■ 4.14
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JMJD8-201ENST00000412368 IFT140Q96RY7 1462 aa40.83■■■■■ 4.13
JMJD8-201ENST00000412368 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.82■■■■■ 4.13
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JMJD8-201ENST00000412368 WDR97A6NE52 1622 aa40.59■■■■■ 4.09
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JMJD8-201ENST00000412368 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
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JMJD8-201ENST00000412368 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.36■■■■■ 4.05
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JMJD8-201ENST00000412368 PBRM1Q86U86 1689 aa40.27■■■■■ 4.04
JMJD8-201ENST00000412368 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.26■■■■■ 4.04
JMJD8-201ENST00000412368 GRIN2BQ13224 1484 aa40.22■■■■■ 4.03
JMJD8-201ENST00000412368 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.16■■■■■ 4.02
JMJD8-201ENST00000412368 KIF27Q86VH2 1401 aa40.11■■■■■ 4.01
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JMJD8-201ENST00000412368 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.03■■■■■ 4
JMJD8-201ENST00000412368 CHD1O14646 1710 aa40■■■■□ 3.99
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JMJD8-201ENST00000412368 NUP160Q12769 1436 aa39.5■■■■□ 3.91
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JMJD8-201ENST00000412368 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.49■■■■□ 3.91
JMJD8-201ENST00000412368 PRXQ9BXM0 1461 aa39.47■■■■□ 3.91
JMJD8-201ENST00000412368 KIF21BO75037 1637 aa39.25■■■■□ 3.87
JMJD8-201ENST00000412368 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.24■■■■□ 3.87
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