RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300811.7

ZNF428-201, Transcript of zinc finger protein 428, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF428, Length 1,412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428-201ENST00000300811 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.34■■■■■ 6.61
ZNF428-201ENST00000300811 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.03■■■■■ 5.6
ZNF428-201ENST00000300811 ABCC9O60706 1549 aa49.11■■■■■ 5.45
ZNF428-201ENST00000300811 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.24■■■■■ 5.15
ZNF428-201ENST00000300811 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.15■■■■■ 5.14
ZNF428-201ENST00000300811 NACADO15069 1562 aa47.08■■■■■ 5.13
ZNF428-201ENST00000300811 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
ZNF428-201ENST00000300811 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.75■■■■■ 5.08
ZNF428-201ENST00000300811 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.56■■■■■ 5.04
ZNF428-201ENST00000300811 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.03■■■■■ 4.96
ZNF428-201ENST00000300811 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.94■■■■■ 4.95
ZNF428-201ENST00000300811 SCRIBQ14160 1630 aa45.75■■■■■ 4.91
ZNF428-201ENST00000300811 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.73■■■■■ 4.91
ZNF428-201ENST00000300811 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.19■■■■■ 4.82
ZNF428-201ENST00000300811 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.11■■■■■ 4.81
ZNF428-201ENST00000300811 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
ZNF428-201ENST00000300811 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.37■■■■■ 4.69
ZNF428-201ENST00000300811 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.11■■■■■ 4.65
ZNF428-201ENST00000300811 SMARCA4P51532 1647 aa43.72■■■■■ 4.59
ZNF428-201ENST00000300811 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
ZNF428-201ENST00000300811 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.51■■■■■ 4.56
ZNF428-201ENST00000300811 NCAPD3P42695 1498 aa43.47■■■■■ 4.55
ZNF428-201ENST00000300811 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.45■■■■■ 4.55
ZNF428-201ENST00000300811 SMARCA2P51531 1590 aa43.42■■■■■ 4.54
ZNF428-201ENST00000300811 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.24■■■■■ 4.51
ZNF428-201ENST00000300811 HMGXB3Q12766 1538 aa43.23■■■■■ 4.51
ZNF428-201ENST00000300811 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
ZNF428-201ENST00000300811 WIZO95785 1651 aa42.97■■■■■ 4.47
ZNF428-201ENST00000300811 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
ZNF428-201ENST00000300811 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
ZNF428-201ENST00000300811 NESP48681 1621 aa42.49■■■■■ 4.39
ZNF428-201ENST00000300811 ERCC6Q03468 1493 aa42.33■■■■■ 4.37
ZNF428-201ENST00000300811 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.31■■■■■ 4.36
ZNF428-201ENST00000300811 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.24■■■■■ 4.35
ZNF428-201ENST00000300811 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.07■■■■■ 4.33
ZNF428-201ENST00000300811 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.04■■■■■ 4.32
ZNF428-201ENST00000300811 CFTRP13569 1480 aa41.95■■■■■ 4.31
ZNF428-201ENST00000300811 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
ZNF428-201ENST00000300811 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.92■■■■■ 4.3
ZNF428-201ENST00000300811 CUX2O14529 1486 aa41.83■■■■■ 4.29
ZNF428-201ENST00000300811 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
ZNF428-201ENST00000300811 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.75■■■■■ 4.27
ZNF428-201ENST00000300811 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.69■■■■■ 4.27
ZNF428-201ENST00000300811 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.63■■■■■ 4.26
ZNF428-201ENST00000300811 PRDM2Q13029 1718 aa41.54■■■■■ 4.24
ZNF428-201ENST00000300811 WDR62O43379 1518 aa41.46■■■■■ 4.23
ZNF428-201ENST00000300811 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
ZNF428-201ENST00000300811 TOPBP1Q92547 1522 aa41.07■■■■■ 4.16
ZNF428-201ENST00000300811 ABCC8Q09428 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
ZNF428-201ENST00000300811 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41■■■■■ 4.15
ZNF428-201ENST00000300811 IFT140Q96RY7 1462 aa40.81■■■■■ 4.12
ZNF428-201ENST00000300811 CUX1P39880 1505 aa40.75■■■■■ 4.11
ZNF428-201ENST00000300811 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
ZNF428-201ENST00000300811 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
ZNF428-201ENST00000300811 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.64■■■■■ 4.1
ZNF428-201ENST00000300811 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.61■■■■■ 4.09
ZNF428-201ENST00000300811 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
ZNF428-201ENST00000300811 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.59■■■■■ 4.09
ZNF428-201ENST00000300811 SOGA1O94964 1423 aa40.58■■■■■ 4.09
ZNF428-201ENST00000300811 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.07
ZNF428-201ENST00000300811 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
ZNF428-201ENST00000300811 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.45■■■■■ 4.07
ZNF428-201ENST00000300811 SYNJ1O43426 1573 aa40.39■■■■■ 4.06
ZNF428-201ENST00000300811 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
ZNF428-201ENST00000300811 TOP2BQ02880 1626 aa40.37■■■■■ 4.05
ZNF428-201ENST00000300811 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.35■■■■■ 4.05
ZNF428-201ENST00000300811 WDR97A6NE52 1622 aa40.22■■■■■ 4.03
ZNF428-201ENST00000300811 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.22■■■■■ 4.03
ZNF428-201ENST00000300811 OSCARQ8IYS5 282 aa40.16■■■■■ 4.02
ZNF428-201ENST00000300811 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.09■■■■■ 4.01
ZNF428-201ENST00000300811 GRIN2BQ13224 1484 aa40.09■■■■■ 4.01
ZNF428-201ENST00000300811 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.06■■■■■ 4
ZNF428-201ENST00000300811 FBLN2P98095 1184 aa40.03■■■■■ 4
ZNF428-201ENST00000300811 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.03■■■■■ 4
ZNF428-201ENST00000300811 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
ZNF428-201ENST00000300811 PBRM1Q86U86 1689 aa39.96■■■■□ 3.99
ZNF428-201ENST00000300811 CHD1O14646 1710 aa39.93■■■■□ 3.98
ZNF428-201ENST00000300811 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
ZNF428-201ENST00000300811 SYNJ2O15056 1496 aa39.82■■■■□ 3.97
ZNF428-201ENST00000300811 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.71■■■■□ 3.95
ZNF428-201ENST00000300811 ADAMTS12P58397 1594 aa39.66■■■■□ 3.94
ZNF428-201ENST00000300811 KIF27Q86VH2 1401 aa39.65■■■■□ 3.94
ZNF428-201ENST00000300811 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.63■■■■□ 3.93
ZNF428-201ENST00000300811 TRIM41Q8WV44 630 aa39.59■■■■□ 3.93
ZNF428-201ENST00000300811 GRIN2AQ12879 1464 aa39.57■■■■□ 3.92
ZNF428-201ENST00000300811 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.51■■■■□ 3.92
ZNF428-201ENST00000300811 IGF1RP08069 1367 aa39.51■■■■□ 3.92
ZNF428-201ENST00000300811 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.47■■■■□ 3.91
ZNF428-201ENST00000300811 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.47■■■■□ 3.91
ZNF428-201ENST00000300811 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.47■■■■□ 3.91
ZNF428-201ENST00000300811 ARHGEF11O15085 1522 aa39.47■■■■□ 3.91
ZNF428-201ENST00000300811 NUP160Q12769 1436 aa39.38■■■■□ 3.89
ZNF428-201ENST00000300811 CEP170Q5SW79 1584 aa39.37■■■■□ 3.89
ZNF428-201ENST00000300811 CUL7Q14999 1698 aa39.34■■■■□ 3.89
ZNF428-201ENST00000300811 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.32■■■■□ 3.88
ZNF428-201ENST00000300811 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.28■■■■□ 3.88
ZNF428-201ENST00000300811 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.18■■■■□ 3.86
ZNF428-201ENST00000300811 ARAP1Q96P48 1450 aa39.17■■■■□ 3.86
ZNF428-201ENST00000300811 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.09■■■■□ 3.85
ZNF428-201ENST00000300811 SHROOM2Q13796 1616 aa39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms