RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.03■■■■■ 6.56
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.14■■■■■ 5.62
KDELR3-202ENST00000409006 ABCC9O60706 1549 aa49.8■■■■■ 5.56
KDELR3-202ENST00000409006 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.51■■■■■ 5.2
KDELR3-202ENST00000409006 NACADO15069 1562 aa47.27■■■■■ 5.16
KDELR3-202ENST00000409006 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.12■■■■■ 5.13
KDELR3-202ENST00000409006 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.7■■■■■ 5.07
KDELR3-202ENST00000409006 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.63■■■■■ 5.06
KDELR3-202ENST00000409006 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
KDELR3-202ENST00000409006 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.45■■■■■ 5.03
KDELR3-202ENST00000409006 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.42■■■■■ 5.02
KDELR3-202ENST00000409006 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.26■■■■■ 5
KDELR3-202ENST00000409006 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.21■■■■■ 4.99
KDELR3-202ENST00000409006 SCRIBQ14160 1630 aa45.75■■■■■ 4.91
KDELR3-202ENST00000409006 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.44■■■■■ 4.87
KDELR3-202ENST00000409006 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.03■■■■■ 4.8
KDELR3-202ENST00000409006 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
KDELR3-202ENST00000409006 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.78■■■■■ 4.76
KDELR3-202ENST00000409006 SMARCA4P51532 1647 aa43.66■■■■■ 4.58
KDELR3-202ENST00000409006 NCAPD3P42695 1498 aa43.64■■■■■ 4.58
KDELR3-202ENST00000409006 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.57■■■■■ 4.57
KDELR3-202ENST00000409006 SMARCA2P51531 1590 aa43.44■■■■■ 4.54
KDELR3-202ENST00000409006 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
KDELR3-202ENST00000409006 HMGXB3Q12766 1538 aa43.34■■■■■ 4.53
KDELR3-202ENST00000409006 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.22■■■■■ 4.51
KDELR3-202ENST00000409006 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.2■■■■■ 4.51
KDELR3-202ENST00000409006 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
KDELR3-202ENST00000409006 NESP48681 1621 aa42.92■■■■■ 4.46
KDELR3-202ENST00000409006 ERCC6Q03468 1493 aa42.9■■■■■ 4.46
KDELR3-202ENST00000409006 WIZO95785 1651 aa42.77■■■■■ 4.44
KDELR3-202ENST00000409006 CUX2O14529 1486 aa42.68■■■■■ 4.42
KDELR3-202ENST00000409006 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.61■■■■■ 4.41
KDELR3-202ENST00000409006 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.43■■■■■ 4.38
KDELR3-202ENST00000409006 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
KDELR3-202ENST00000409006 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
KDELR3-202ENST00000409006 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.31■■■■■ 4.36
KDELR3-202ENST00000409006 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.29■■■■■ 4.36
KDELR3-202ENST00000409006 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.29■■■■■ 4.36
KDELR3-202ENST00000409006 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
KDELR3-202ENST00000409006 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.95■■■■■ 4.31
KDELR3-202ENST00000409006 CFTRP13569 1480 aa41.93■■■■■ 4.3
KDELR3-202ENST00000409006 WDR62O43379 1518 aa41.86■■■■■ 4.29
KDELR3-202ENST00000409006 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.85■■■■■ 4.29
KDELR3-202ENST00000409006 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.85■■■■■ 4.29
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.71■■■■■ 4.27
KDELR3-202ENST00000409006 PRDM2Q13029 1718 aa41.66■■■■■ 4.26
KDELR3-202ENST00000409006 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
KDELR3-202ENST00000409006 TOPBP1Q92547 1522 aa41.13■■■■■ 4.18
KDELR3-202ENST00000409006 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41■■■■■ 4.15
KDELR3-202ENST00000409006 IFT140Q96RY7 1462 aa40.99■■■■■ 4.15
KDELR3-202ENST00000409006 ABCC8Q09428 1581 aa40.98■■■■■ 4.15
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
KDELR3-202ENST00000409006 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
KDELR3-202ENST00000409006 OSCARQ8IYS5 282 aa40.8■■■■■ 4.12
KDELR3-202ENST00000409006 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
KDELR3-202ENST00000409006 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
KDELR3-202ENST00000409006 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
KDELR3-202ENST00000409006 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.09
KDELR3-202ENST00000409006 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.61■■■■■ 4.09
KDELR3-202ENST00000409006 TRIM41Q8WV44 630 aa40.6■■■■■ 4.09
KDELR3-202ENST00000409006 CUX1P39880 1505 aa40.58■■■■■ 4.09
KDELR3-202ENST00000409006 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.53■■■■■ 4.08
KDELR3-202ENST00000409006 SOGA1O94964 1423 aa40.52■■■■■ 4.08
KDELR3-202ENST00000409006 CHD1O14646 1710 aa40.45■■■■■ 4.07
KDELR3-202ENST00000409006 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
KDELR3-202ENST00000409006 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
KDELR3-202ENST00000409006 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
KDELR3-202ENST00000409006 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
KDELR3-202ENST00000409006 WDR97A6NE52 1622 aa40.29■■■■■ 4.04
KDELR3-202ENST00000409006 FBLN2P98095 1184 aa40.24■■■■■ 4.03
KDELR3-202ENST00000409006 ARHGEF11O15085 1522 aa40.21■■■■■ 4.03
KDELR3-202ENST00000409006 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.2■■■■■ 4.03
KDELR3-202ENST00000409006 GRIN2BQ13224 1484 aa40.11■■■■■ 4.01
KDELR3-202ENST00000409006 PBRM1Q86U86 1689 aa40.1■■■■■ 4.01
KDELR3-202ENST00000409006 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
KDELR3-202ENST00000409006 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.07■■■■■ 4.01
KDELR3-202ENST00000409006 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.04■■■■■ 4
KDELR3-202ENST00000409006 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.04■■■■■ 4
KDELR3-202ENST00000409006 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.02■■■■■ 4
KDELR3-202ENST00000409006 SYNJ1O43426 1573 aa40.01■■■■■ 4
KDELR3-202ENST00000409006 TOP2BQ02880 1626 aa40.01■■■■■ 4
KDELR3-202ENST00000409006 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.99■■■■□ 3.99
KDELR3-202ENST00000409006 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
KDELR3-202ENST00000409006 SYNJ2O15056 1496 aa39.94■■■■□ 3.98
KDELR3-202ENST00000409006 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.92■■■■□ 3.98
KDELR3-202ENST00000409006 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.87■■■■□ 3.97
KDELR3-202ENST00000409006 ARAP1Q96P48 1450 aa39.85■■■■□ 3.97
KDELR3-202ENST00000409006 ADAMTS12P58397 1594 aa39.68■■■■□ 3.94
KDELR3-202ENST00000409006 GRIN2AQ12879 1464 aa39.62■■■■□ 3.93
KDELR3-202ENST00000409006 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.56■■■■□ 3.92
KDELR3-202ENST00000409006 CEP170Q5SW79 1584 aa39.52■■■■□ 3.92
KDELR3-202ENST00000409006 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.52■■■■□ 3.92
KDELR3-202ENST00000409006 NUP160Q12769 1436 aa39.48■■■■□ 3.91
KDELR3-202ENST00000409006 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.4■■■■□ 3.9
KDELR3-202ENST00000409006 SHROOM2Q13796 1616 aa39.32■■■■□ 3.88
KDELR3-202ENST00000409006 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
KDELR3-202ENST00000409006 KIF27Q86VH2 1401 aa39.17■■■■□ 3.86
KDELR3-202ENST00000409006 IGF1RP08069 1367 aa39.16■■■■□ 3.86
KDELR3-202ENST00000409006 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.12■■■■□ 3.85
KDELR3-202ENST00000409006 CUL7Q14999 1698 aa39.08■■■■□ 3.85
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