RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602548.2

CENPVL1-201, Transcript of centromere protein V like 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CENPVL1, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1-201ENST00000602548 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.61■■■■■ 6.65
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CENPVL1-201ENST00000602548 SCRIBQ14160 1630 aa45.73■■■■■ 4.91
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CENPVL1-201ENST00000602548 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.81■■■■■ 4.6
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CENPVL1-201ENST00000602548 SMARCA2P51531 1590 aa43.4■■■■■ 4.54
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CENPVL1-201ENST00000602548 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.07■■■■■ 4.32
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CENPVL1-201ENST00000602548 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.6■■■■■ 4.25
CENPVL1-201ENST00000602548 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.57■■■■■ 4.25
CENPVL1-201ENST00000602548 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.49■■■■■ 4.23
CENPVL1-201ENST00000602548 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.3■■■■■ 4.2
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CENPVL1-201ENST00000602548 ABCC8Q09428 1581 aa41.04■■■■■ 4.16
CENPVL1-201ENST00000602548 CUX2O14529 1486 aa41.03■■■■■ 4.16
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CENPVL1-201ENST00000602548 TOPBP1Q92547 1522 aa40.99■■■■■ 4.15
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CENPVL1-201ENST00000602548 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
CENPVL1-201ENST00000602548 SYNJ1O43426 1573 aa40.73■■■■■ 4.11
CENPVL1-201ENST00000602548 TOP2BQ02880 1626 aa40.71■■■■■ 4.11
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CENPVL1-201ENST00000602548 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
CENPVL1-201ENST00000602548 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.32■■■■■ 4.04
CENPVL1-201ENST00000602548 WDR97A6NE52 1622 aa40.29■■■■■ 4.04
CENPVL1-201ENST00000602548 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.24■■■■■ 4.03
CENPVL1-201ENST00000602548 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
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CENPVL1-201ENST00000602548 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
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CENPVL1-201ENST00000602548 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.08■■■■■ 4.01
CENPVL1-201ENST00000602548 GRIN2BQ13224 1484 aa40■■■■□ 3.99
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CENPVL1-201ENST00000602548 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.84■■■■□ 3.97
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CENPVL1-201ENST00000602548 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.36■■■■□ 3.89
CENPVL1-201ENST00000602548 NUP160Q12769 1436 aa39.28■■■■□ 3.88
CENPVL1-201ENST00000602548 CEP170Q5SW79 1584 aa39.25■■■■□ 3.87
CENPVL1-201ENST00000602548 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.17■■■■□ 3.86
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CENPVL1-201ENST00000602548 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.06■■■■□ 3.84
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