Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAE1P78406 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAE1P78406 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAE1P78406 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAE1P78406 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAE1P78406 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAE1P78406 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAE1P78406 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAE1P78406 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAE1P78406 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAE1P78406 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAE1P78406 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAE1P78406 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAE1P78406 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAE1P78406 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAE1P78406 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAE1P78406 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAE1P78406 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAE1P78406 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAE1P78406 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAE1P78406 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAE1P78406 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAE1P78406 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAE1P78406 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAE1P78406 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAE1P78406 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAE1P78406 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAE1P78406 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAE1P78406 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAE1P78406 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAE1P78406 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAE1P78406 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAE1P78406 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAE1P78406 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAE1P78406 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAE1P78406 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAE1P78406 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAE1P78406 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAE1P78406 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAE1P78406 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAE1P78406 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAE1P78406 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAE1P78406 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAE1P78406 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAE1P78406 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAE1P78406 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAE1P78406 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAE1P78406 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAE1P78406 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAE1P78406 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAE1P78406 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAE1P78406 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAE1P78406 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAE1P78406 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAE1P78406 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAE1P78406 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAE1P78406 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RAE1P78406 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAE1P78406 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAE1P78406 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAE1P78406 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAE1P78406 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAE1P78406 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAE1P78406 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAE1P78406 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAE1P78406 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms