Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SBK2P0C263 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK2P0C263 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SBK2P0C263 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK2P0C263 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK2P0C263 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK2P0C263 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK2P0C263 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK2P0C263 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK2P0C263 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK2P0C263 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms