Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBY3A6NI87 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBY3A6NI87 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms