Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms