Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CUL4AQ13619 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CUL4AQ13619 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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