Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX8Q6ZV50 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX8Q6ZV50 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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