RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544305.5

EPHB2-207, Transcript of EPH receptor B2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EPHB2, Length 1,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2-207ENST00000544305 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.79■■■■■ 6.84
EPHB2-207ENST00000544305 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.98■■■■■ 5.75
EPHB2-207ENST00000544305 ABCC9O60706 1549 aa49.32■■■■■ 5.49
EPHB2-207ENST00000544305 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.28■■■■■ 5.32
EPHB2-207ENST00000544305 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.17■■■■■ 5.3
EPHB2-207ENST00000544305 NACADO15069 1562 aa47.8■■■■■ 5.24
EPHB2-207ENST00000544305 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.79■■■■■ 5.24
EPHB2-207ENST00000544305 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.71■■■■■ 5.23
EPHB2-207ENST00000544305 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.69■■■■■ 5.23
EPHB2-207ENST00000544305 SCRIBQ14160 1630 aa46.68■■■■■ 5.06
EPHB2-207ENST00000544305 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.57■■■■■ 5.05
EPHB2-207ENST00000544305 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.26■■■■■ 5
EPHB2-207ENST00000544305 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.24■■■■■ 4.99
EPHB2-207ENST00000544305 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.21■■■■■ 4.99
EPHB2-207ENST00000544305 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.98■■■■■ 4.79
EPHB2-207ENST00000544305 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
EPHB2-207ENST00000544305 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
EPHB2-207ENST00000544305 SMARCA4P51532 1647 aa44.67■■■■■ 4.74
EPHB2-207ENST00000544305 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.61■■■■■ 4.73
EPHB2-207ENST00000544305 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.6■■■■■ 4.73
EPHB2-207ENST00000544305 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.58■■■■■ 4.73
EPHB2-207ENST00000544305 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
EPHB2-207ENST00000544305 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.27■■■■■ 4.68
EPHB2-207ENST00000544305 SMARCA2P51531 1590 aa44.23■■■■■ 4.67
EPHB2-207ENST00000544305 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.18■■■■■ 4.66
EPHB2-207ENST00000544305 WIZO95785 1651 aa44.13■■■■■ 4.66
EPHB2-207ENST00000544305 NCAPD3P42695 1498 aa44.12■■■■■ 4.65
EPHB2-207ENST00000544305 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
EPHB2-207ENST00000544305 HMGXB3Q12766 1538 aa43.94■■■■■ 4.63
EPHB2-207ENST00000544305 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
EPHB2-207ENST00000544305 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
EPHB2-207ENST00000544305 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.2■■■■■ 4.51
EPHB2-207ENST00000544305 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.91■■■■■ 4.46
EPHB2-207ENST00000544305 NESP48681 1621 aa42.89■■■■■ 4.46
EPHB2-207ENST00000544305 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.82■■■■■ 4.45
EPHB2-207ENST00000544305 CFTRP13569 1480 aa42.78■■■■■ 4.44
EPHB2-207ENST00000544305 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.56■■■■■ 4.4
EPHB2-207ENST00000544305 ERCC6Q03468 1493 aa42.46■■■■■ 4.39
EPHB2-207ENST00000544305 PRDM2Q13029 1718 aa42.44■■■■■ 4.38
EPHB2-207ENST00000544305 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.42■■■■■ 4.38
EPHB2-207ENST00000544305 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.34■■■■■ 4.37
EPHB2-207ENST00000544305 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.28■■■■■ 4.36
EPHB2-207ENST00000544305 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.06■■■■■ 4.32
EPHB2-207ENST00000544305 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
EPHB2-207ENST00000544305 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
EPHB2-207ENST00000544305 WDR62O43379 1518 aa41.87■■■■■ 4.29
EPHB2-207ENST00000544305 ABCC8Q09428 1581 aa41.87■■■■■ 4.29
EPHB2-207ENST00000544305 TOPBP1Q92547 1522 aa41.81■■■■■ 4.28
EPHB2-207ENST00000544305 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
EPHB2-207ENST00000544305 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.8■■■■■ 4.28
EPHB2-207ENST00000544305 CUX1P39880 1505 aa41.77■■■■■ 4.28
EPHB2-207ENST00000544305 CUX2O14529 1486 aa41.67■■■■■ 4.26
EPHB2-207ENST00000544305 SYNJ1O43426 1573 aa41.63■■■■■ 4.25
EPHB2-207ENST00000544305 TOP2BQ02880 1626 aa41.58■■■■■ 4.25
EPHB2-207ENST00000544305 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.55■■■■■ 4.24
EPHB2-207ENST00000544305 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
EPHB2-207ENST00000544305 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
EPHB2-207ENST00000544305 TRIM41Q8WV44 630 aa41.39■■■■■ 4.22
EPHB2-207ENST00000544305 SOGA1O94964 1423 aa41.39■■■■■ 4.22
EPHB2-207ENST00000544305 IFT140Q96RY7 1462 aa41.36■■■■■ 4.21
EPHB2-207ENST00000544305 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.35■■■■■ 4.21
EPHB2-207ENST00000544305 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.35■■■■■ 4.21
EPHB2-207ENST00000544305 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
EPHB2-207ENST00000544305 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
EPHB2-207ENST00000544305 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.13■■■■■ 4.18
EPHB2-207ENST00000544305 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
EPHB2-207ENST00000544305 WDR97A6NE52 1622 aa41.07■■■■■ 4.16
EPHB2-207ENST00000544305 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.02■■■■■ 4.16
EPHB2-207ENST00000544305 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
EPHB2-207ENST00000544305 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.9■■■■■ 4.14
EPHB2-207ENST00000544305 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.87■■■■■ 4.13
EPHB2-207ENST00000544305 KIF27Q86VH2 1401 aa40.86■■■■■ 4.13
EPHB2-207ENST00000544305 GRIN2BQ13224 1484 aa40.78■■■■■ 4.12
EPHB2-207ENST00000544305 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.74■■■■■ 4.11
EPHB2-207ENST00000544305 PBRM1Q86U86 1689 aa40.71■■■■■ 4.11
EPHB2-207ENST00000544305 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.64■■■■■ 4.1
EPHB2-207ENST00000544305 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.64■■■■■ 4.1
EPHB2-207ENST00000544305 IGF1RP08069 1367 aa40.62■■■■■ 4.09
EPHB2-207ENST00000544305 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
EPHB2-207ENST00000544305 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
EPHB2-207ENST00000544305 EEA1Q15075 1411 aa40.55■■■■■ 4.08
EPHB2-207ENST00000544305 FBLN2P98095 1184 aa40.47■■■■■ 4.07
EPHB2-207ENST00000544305 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.46■■■■■ 4.07
EPHB2-207ENST00000544305 ADAMTS12P58397 1594 aa40.45■■■■■ 4.07
EPHB2-207ENST00000544305 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.45■■■■■ 4.07
EPHB2-207ENST00000544305 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
EPHB2-207ENST00000544305 SYNJ2O15056 1496 aa40.42■■■■■ 4.06
EPHB2-207ENST00000544305 CUL7Q14999 1698 aa40.41■■■■■ 4.06
EPHB2-207ENST00000544305 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.4■■■■■ 4.06
EPHB2-207ENST00000544305 CHD1O14646 1710 aa40.3■■■■■ 4.04
EPHB2-207ENST00000544305 GRIN2AQ12879 1464 aa40.25■■■■■ 4.03
EPHB2-207ENST00000544305 PRXQ9BXM0 1461 aa40.24■■■■■ 4.03
EPHB2-207ENST00000544305 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.23■■■■■ 4.03
EPHB2-207ENST00000544305 OSCARQ8IYS5 282 aa40.16■■■■■ 4.02
EPHB2-207ENST00000544305 KIF21BO75037 1637 aa40.05■■■■■ 4
EPHB2-207ENST00000544305 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.04■■■■■ 4
EPHB2-207ENST00000544305 NUP160Q12769 1436 aa40.02■■■■■ 4
EPHB2-207ENST00000544305 CEP170Q5SW79 1584 aa40.02■■■■■ 4
EPHB2-207ENST00000544305 GOLGA3Q08378 1498 aa39.92■■■■□ 3.98
EPHB2-207ENST00000544305 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.87■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms