Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX1T1Q06455 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1T1Q06455 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms