Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYBB3P26998 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBB3P26998 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms