Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COQ9O75208 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COQ9O75208 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COQ9O75208 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COQ9O75208 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COQ9O75208 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COQ9O75208 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COQ9O75208 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COQ9O75208 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COQ9O75208 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COQ9O75208 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COQ9O75208 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COQ9O75208 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COQ9O75208 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COQ9O75208 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COQ9O75208 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COQ9O75208 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COQ9O75208 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COQ9O75208 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COQ9O75208 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COQ9O75208 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COQ9O75208 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COQ9O75208 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COQ9O75208 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COQ9O75208 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COQ9O75208 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COQ9O75208 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COQ9O75208 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COQ9O75208 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COQ9O75208 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COQ9O75208 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COQ9O75208 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ9O75208 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ9O75208 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ9O75208 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ9O75208 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ9O75208 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ9O75208 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ9O75208 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ9O75208 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ9O75208 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ9O75208 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ9O75208 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ9O75208 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ9O75208 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ9O75208 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ9O75208 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ9O75208 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ9O75208 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ9O75208 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ9O75208 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ9O75208 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ9O75208 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ9O75208 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ9O75208 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ9O75208 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ9O75208 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ9O75208 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ9O75208 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ9O75208 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ9O75208 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ9O75208 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ9O75208 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ9O75208 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ9O75208 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ9O75208 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ9O75208 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ9O75208 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ9O75208 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ9O75208 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COQ9O75208 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COQ9O75208 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COQ9O75208 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COQ9O75208 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COQ9O75208 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COQ9O75208 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COQ9O75208 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COQ9O75208 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COQ9O75208 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COQ9O75208 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COQ9O75208 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COQ9O75208 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COQ9O75208 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COQ9O75208 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COQ9O75208 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COQ9O75208 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COQ9O75208 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COQ9O75208 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COQ9O75208 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms