Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEMFO60524 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEMFO60524 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEMFO60524 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEMFO60524 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEMFO60524 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEMFO60524 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEMFO60524 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEMFO60524 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEMFO60524 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEMFO60524 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEMFO60524 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEMFO60524 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEMFO60524 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEMFO60524 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEMFO60524 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEMFO60524 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEMFO60524 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEMFO60524 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEMFO60524 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEMFO60524 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEMFO60524 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NEMFO60524 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEMFO60524 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NEMFO60524 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEMFO60524 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEMFO60524 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEMFO60524 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEMFO60524 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEMFO60524 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEMFO60524 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEMFO60524 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEMFO60524 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEMFO60524 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEMFO60524 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEMFO60524 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEMFO60524 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEMFO60524 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEMFO60524 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEMFO60524 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEMFO60524 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEMFO60524 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEMFO60524 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEMFO60524 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEMFO60524 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEMFO60524 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEMFO60524 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEMFO60524 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEMFO60524 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEMFO60524 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEMFO60524 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEMFO60524 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEMFO60524 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEMFO60524 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEMFO60524 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEMFO60524 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEMFO60524 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEMFO60524 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEMFO60524 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEMFO60524 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEMFO60524 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEMFO60524 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEMFO60524 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEMFO60524 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEMFO60524 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEMFO60524 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEMFO60524 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEMFO60524 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEMFO60524 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEMFO60524 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEMFO60524 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEMFO60524 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEMFO60524 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEMFO60524 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEMFO60524 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEMFO60524 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEMFO60524 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEMFO60524 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NEMFO60524 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEMFO60524 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEMFO60524 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEMFO60524 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NEMFO60524 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEMFO60524 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEMFO60524 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEMFO60524 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEMFO60524 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEMFO60524 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEMFO60524 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEMFO60524 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NEMFO60524 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEMFO60524 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEMFO60524 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEMFO60524 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEMFO60524 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEMFO60524 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEMFO60524 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEMFO60524 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEMFO60524 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEMFO60524 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms