Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF11Q9UIL8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF11Q9UIL8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms