Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDF4Q9BRK5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDF4Q9BRK5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SDF4Q9BRK5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms