Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNC2Q96PR1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC2Q96PR1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms