Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE23Q8NDY6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE23Q8NDY6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms