Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNTD2Q8IXW0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNTD2Q8IXW0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms