Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGNBQ7Z5D8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGNBQ7Z5D8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGNBQ7Z5D8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGNBQ7Z5D8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms