Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARID5AQ03989 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID5AQ03989 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms