Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG1P45844 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCG1P45844 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCG1P45844 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms