Protein–RNA interactions for Protein: O95379

TNFAIP8, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8O95379 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFAIP8O95379 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8O95379 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFAIP8O95379 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms