Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP3O15049 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP3O15049 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
N4BP3O15049 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP3O15049 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP3O15049 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP3O15049 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms