Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FARSAQ9Y285 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARSAQ9Y285 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARSAQ9Y285 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARSAQ9Y285 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms