Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTPS2Q9NRF8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTPS2Q9NRF8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms