Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF407Q9C0G0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF407Q9C0G0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF407Q9C0G0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms