Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HERC2P3Q9BVR0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC2P3Q9BVR0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC2P3Q9BVR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms