Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC44.94■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
RSF1Q96T23 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
RSF1Q96T23 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC44.78■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC44.78■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC44.75■■■■■ 4.76
RSF1Q96T23 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
RSF1Q96T23 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
RSF1Q96T23 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RSF1Q96T23 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms