Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNT1Q96Q11 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRNT1Q96Q11 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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