Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOX2Q8IUF8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOX2Q8IUF8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOX2Q8IUF8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RIOX2Q8IUF8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RIOX2Q8IUF8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RIOX2Q8IUF8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RIOX2Q8IUF8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIOX2Q8IUF8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIOX2Q8IUF8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOX2Q8IUF8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms