Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARMC3Q5W041 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARMC3Q5W041 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARMC3Q5W041 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms