Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA4P35212 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA4P35212 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA4P35212 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA4P35212 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA4P35212 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA4P35212 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA4P35212 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA4P35212 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA4P35212 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA4P35212 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA4P35212 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA4P35212 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA4P35212 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA4P35212 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA4P35212 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA4P35212 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA4P35212 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA4P35212 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA4P35212 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA4P35212 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA4P35212 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA4P35212 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA4P35212 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA4P35212 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA4P35212 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA4P35212 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA4P35212 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA4P35212 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA4P35212 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA4P35212 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA4P35212 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA4P35212 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA4P35212 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA4P35212 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA4P35212 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA4P35212 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA4P35212 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA4P35212 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA4P35212 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA4P35212 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA4P35212 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA4P35212 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA4P35212 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA4P35212 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA4P35212 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA4P35212 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA4P35212 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA4P35212 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA4P35212 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA4P35212 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA4P35212 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA4P35212 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA4P35212 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA4P35212 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA4P35212 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA4P35212 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA4P35212 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA4P35212 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA4P35212 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA4P35212 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA4P35212 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA4P35212 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA4P35212 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA4P35212 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA4P35212 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA4P35212 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA4P35212 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA4P35212 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA4P35212 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA4P35212 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA4P35212 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA4P35212 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA4P35212 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA4P35212 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA4P35212 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA4P35212 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA4P35212 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA4P35212 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA4P35212 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA4P35212 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA4P35212 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA4P35212 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA4P35212 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA4P35212 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA4P35212 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms