Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GJA4P35212 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJA4P35212 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GJA4P35212 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GJA4P35212 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GJA4P35212 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GJA4P35212 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GJA4P35212 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
GJA4P35212 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GJA4P35212 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GJA4P35212 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GJA4P35212 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJA4P35212 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJA4P35212 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJA4P35212 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GJA4P35212 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GJA4P35212 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
GJA4P35212 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GJA4P35212 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GJA4P35212 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJA4P35212 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJA4P35212 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GJA4P35212 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GJA4P35212 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJA4P35212 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJA4P35212 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJA4P35212 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GJA4P35212 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJA4P35212 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GJA4P35212 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJA4P35212 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJA4P35212 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJA4P35212 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GJA4P35212 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
GJA4P35212 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJA4P35212 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJA4P35212 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
GJA4P35212 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJA4P35212 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
GJA4P35212 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJA4P35212 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJA4P35212 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJA4P35212 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJA4P35212 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJA4P35212 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJA4P35212 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJA4P35212 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJA4P35212 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GJA4P35212 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJA4P35212 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJA4P35212 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJA4P35212 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJA4P35212 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GJA4P35212 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJA4P35212 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJA4P35212 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJA4P35212 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJA4P35212 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJA4P35212 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJA4P35212 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJA4P35212 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJA4P35212 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJA4P35212 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GJA4P35212 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GJA4P35212 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GJA4P35212 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GJA4P35212 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJA4P35212 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJA4P35212 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GJA4P35212 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GJA4P35212 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GJA4P35212 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GJA4P35212 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GJA4P35212 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GJA4P35212 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GJA4P35212 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GJA4P35212 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJA4P35212 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJA4P35212 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA4P35212 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJA4P35212 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJA4P35212 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA4P35212 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJA4P35212 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJA4P35212 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJA4P35212 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA4P35212 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA4P35212 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJA4P35212 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GJA4P35212 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJA4P35212 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA4P35212 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA4P35212 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA4P35212 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA4P35212 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA4P35212 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA4P35212 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
GJA4P35212 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GJA4P35212 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJA4P35212 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms