Protein–RNA interactions for Protein: O60499

STX10, Syntaxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX10O60499 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STX10O60499 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STX10O60499 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STX10O60499 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
STX10O60499 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STX10O60499 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STX10O60499 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX10O60499 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX10O60499 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX10O60499 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX10O60499 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX10O60499 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STX10O60499 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX10O60499 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX10O60499 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX10O60499 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX10O60499 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STX10O60499 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
STX10O60499 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STX10O60499 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STX10O60499 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STX10O60499 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STX10O60499 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
STX10O60499 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX10O60499 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX10O60499 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX10O60499 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX10O60499 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX10O60499 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX10O60499 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX10O60499 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX10O60499 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX10O60499 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX10O60499 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX10O60499 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX10O60499 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX10O60499 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX10O60499 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX10O60499 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX10O60499 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX10O60499 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX10O60499 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX10O60499 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX10O60499 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
STX10O60499 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX10O60499 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX10O60499 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX10O60499 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX10O60499 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX10O60499 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX10O60499 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STX10O60499 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STX10O60499 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX10O60499 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX10O60499 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX10O60499 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX10O60499 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX10O60499 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX10O60499 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX10O60499 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX10O60499 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX10O60499 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX10O60499 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX10O60499 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX10O60499 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX10O60499 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX10O60499 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX10O60499 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX10O60499 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX10O60499 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX10O60499 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX10O60499 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX10O60499 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX10O60499 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX10O60499 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX10O60499 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX10O60499 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX10O60499 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX10O60499 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX10O60499 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX10O60499 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX10O60499 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX10O60499 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
STX10O60499 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
STX10O60499 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
STX10O60499 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX10O60499 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX10O60499 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX10O60499 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX10O60499 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX10O60499 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms