Protein–RNA interactions for Protein: O60462

NRP2, Neuropilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRP2O60462 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRP2O60462 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRP2O60462 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRP2O60462 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRP2O60462 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRP2O60462 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRP2O60462 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRP2O60462 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NRP2O60462 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRP2O60462 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRP2O60462 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRP2O60462 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRP2O60462 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRP2O60462 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRP2O60462 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRP2O60462 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRP2O60462 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRP2O60462 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRP2O60462 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRP2O60462 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRP2O60462 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRP2O60462 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRP2O60462 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRP2O60462 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRP2O60462 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRP2O60462 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRP2O60462 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRP2O60462 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRP2O60462 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRP2O60462 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRP2O60462 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRP2O60462 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NRP2O60462 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRP2O60462 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRP2O60462 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRP2O60462 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRP2O60462 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRP2O60462 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRP2O60462 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRP2O60462 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRP2O60462 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NRP2O60462 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRP2O60462 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRP2O60462 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRP2O60462 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRP2O60462 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRP2O60462 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRP2O60462 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRP2O60462 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRP2O60462 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRP2O60462 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRP2O60462 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRP2O60462 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRP2O60462 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRP2O60462 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NRP2O60462 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRP2O60462 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRP2O60462 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRP2O60462 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRP2O60462 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRP2O60462 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRP2O60462 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRP2O60462 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRP2O60462 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRP2O60462 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRP2O60462 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRP2O60462 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRP2O60462 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRP2O60462 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRP2O60462 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRP2O60462 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NRP2O60462 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRP2O60462 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRP2O60462 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRP2O60462 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NRP2O60462 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRP2O60462 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRP2O60462 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRP2O60462 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRP2O60462 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRP2O60462 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRP2O60462 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRP2O60462 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRP2O60462 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRP2O60462 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 322 ms