Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCO2O43819 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCO2O43819 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCO2O43819 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCO2O43819 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCO2O43819 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCO2O43819 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCO2O43819 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCO2O43819 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCO2O43819 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCO2O43819 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCO2O43819 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCO2O43819 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCO2O43819 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCO2O43819 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCO2O43819 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCO2O43819 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCO2O43819 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCO2O43819 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCO2O43819 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCO2O43819 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCO2O43819 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCO2O43819 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCO2O43819 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCO2O43819 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCO2O43819 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCO2O43819 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCO2O43819 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCO2O43819 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO2O43819 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO2O43819 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO2O43819 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO2O43819 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO2O43819 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO2O43819 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO2O43819 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO2O43819 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCO2O43819 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCO2O43819 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCO2O43819 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCO2O43819 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCO2O43819 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCO2O43819 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCO2O43819 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCO2O43819 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCO2O43819 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCO2O43819 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCO2O43819 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO2O43819 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO2O43819 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO2O43819 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO2O43819 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO2O43819 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO2O43819 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO2O43819 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO2O43819 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO2O43819 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCO2O43819 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCO2O43819 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCO2O43819 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCO2O43819 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO2O43819 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO2O43819 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO2O43819 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO2O43819 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO2O43819 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO2O43819 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO2O43819 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO2O43819 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCO2O43819 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCO2O43819 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCO2O43819 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCO2O43819 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCO2O43819 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCO2O43819 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCO2O43819 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCO2O43819 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCO2O43819 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCO2O43819 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCO2O43819 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCO2O43819 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCO2O43819 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCO2O43819 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCO2O43819 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCO2O43819 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCO2O43819 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCO2O43819 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCO2O43819 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCO2O43819 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCO2O43819 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCO2O43819 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCO2O43819 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 455.6 ms