Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF28PB7ZC32 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF28PB7ZC32 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms