Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NJR5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NJR5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A6NJR5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A6NJR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A6NJR5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A6NJR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A6NJR5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A6NJR5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A6NJR5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A6NJR5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A6NJR5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A6NJR5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A6NJR5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A6NJR5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
A6NJR5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A6NJR5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A6NJR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A6NJR5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
A6NJR5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A6NJR5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A6NJR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A6NJR5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A6NJR5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A6NJR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
A6NJR5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A6NJR5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A6NJR5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A6NJR5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
A6NJR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A6NJR5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A6NJR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A6NJR5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NJR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NJR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NJR5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NJR5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NJR5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NJR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NJR5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NJR5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A6NJR5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A6NJR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A6NJR5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A6NJR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A6NJR5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A6NJR5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A6NJR5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A6NJR5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A6NJR5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A6NJR5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A6NJR5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A6NJR5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NJR5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NJR5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NJR5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NJR5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NJR5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NJR5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NJR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A6NJR5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A6NJR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A6NJR5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
A6NJR5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A6NJR5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A6NJR5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A6NJR5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
A6NJR5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A6NJR5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A6NJR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A6NJR5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A6NJR5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A6NJR5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A6NJR5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A6NJR5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
A6NJR5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A6NJR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A6NJR5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A6NJR5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A6NJR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A6NJR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A6NJR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A6NJR5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A6NJR5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
A6NJR5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A6NJR5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
A6NJR5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A6NJR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A6NJR5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A6NJR5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A6NJR5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A6NJR5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
A6NJR5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A6NJR5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A6NJR5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A6NJR5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
A6NJR5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A6NJR5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A6NJR5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NJR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms