Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRD1A4D1F6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRD1A4D1F6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms