Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ARFGEF2Q9Y6D5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ARFGEF2Q9Y6D5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ARFGEF2Q9Y6D5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ARFGEF2Q9Y6D5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ARFGEF2Q9Y6D5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ARFGEF2Q9Y6D5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms