Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXND1Q9Y4D7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXND1Q9Y4D7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms