Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC13Q9NSE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC13Q9NSE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC13Q9NSE7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC13Q9NSE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms