Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRA1Q9HD15 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRA1Q9HD15 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms