Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POPDC2Q9HBU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POPDC2Q9HBU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POPDC2Q9HBU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POPDC2Q9HBU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms