Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF2Q9BZW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF2Q9BZW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TM6SF2Q9BZW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms