Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP5Q9BXF6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms