Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TIPINQ9BVW5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TIPINQ9BVW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TIPINQ9BVW5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms